Mille ans après la guerre de la Magi, les civilisations ont été rebâties grâce aux avancées de la technologie. L'utilisation de la magie ne relève maintenant plus que de la vieille légende. Pourtant, depuis peu de temps, l'Empire de Gesthal a recours à une force mystérieuse nommée "magitek" pour envahir petit à petit tous les autres états. Alors que le jeu commence, une mystérieuse créature magique est découverte dans les mines de la petite ville de Narshe. Deux soldats de l'Empire et une étrange jeune femme sont envoyés sur place pour constater la découverte. Mais la créature, qu'on appelle un Esper, réagit au contact de la jeune femme. La magie a-t-elle vraiment disparu ? Quels sont les desseins de l'empereur Gesthal ? D'où vient cette mystérieuse jeune femme ?
La corporation Shinra, une
société tellement puissante qu'elle dirige le monde à elle toute
seule, exploite depuis quelques années l'énergie Mako, la force qui
constitue la planète. Mais un groupe écologiste nommé AVALANCHE
veut sensibiliser la population sur un problème : l'énergie Mako
est indispensable à la survie de la planète. Quand la Shinra aura
exploité toute la Mako, la planète mourra et entraînera tout le
monde dans les ténèbres. C'est à coup d'attentats dans les
réacteurs Mako de la mégapole Midgar qu'AVALANCHE fait entendre sa
voix. Cloud Strife, un jeune mercenaire qui dit avoir fait partie
de l'unité d'élite de la Shinra, le SOLDAT, vient tout juste de
rejoindre le groupe. Cependant, des événements ayant eu lieu cinq
ans auparavant vont commencer à avoir de graves répercussions sur
l'avenir de la planète.
L'université de Balamb Garden est
reconnue dans 
le monde entier pour former une prestigieuse élite de
combattants nommé les Seeds. Squall Leonheart, un jeune homme de 17
ans plutôt taciturne, est sur le point de finir ses études et de
recevoir le fameux titre de Seed. Sa dernière mission l'envoie avec
d'autres élèves à Dollet. Ce petit pays, qui se trouve de l'autre
côté de l'océan, a récemment été envahi par la puissante armée de
Galbadia, une république qui s'apparente davantage à une dictature
depuis l'arrivée au pouvoir de Winzer Deling. Mais la mission de
Squall et de ses camarades se termine d'une manière imprévue et ne
préfigure que le début d'un conflit mondial. Pourquoi Galbadia veut
remettre en service la station émettrice de Dollet ? Les questions
se feront plus nombreuses encore alors que l'intrigue avancera. Ce
n'est que le début d'une aventure hors du commun.
C'est l'effervescence à
Alexandrie. Un vaisseau volant est sur le point d'arriver pour
donner la représentation d'une pièce de théâtre. Nobles de Tréno
aux places d'honneur comme bas peuple d'Alexandrie au-dessus des
toits, chacun veut voir "Je veux être ton oisillon" interprété par
un groupe originaire de Lindblum et au sein duquel se trouve un
jeune homme nommé Djidane. Mais il ne s'agit là que d'une
couverture, puisque la vraie mission des acteurs est de kidnapper
la princesse d'Alexandrie, la jeune Grenat, pour la ramener auprès
du Roi Cid, son oncle. Et il se trouve que celle-ci désire
justement se faire enlever afin avertir le Roi des sombres desseins
de sa mère. Les choses tournent mal quand la Reine Branet découvre
le complot, et lance, dans un élan de folie, une bombe sur le
vaisseau volant Prima Vista. Endommagé par l'explosion, il s'écrase
finalement non loin de la ville...
Il y a mille ans, une terrible guerre
faisait rage entre deux puissantes villes-machine, Zanarkand et
Bevelle. Au paroxysme de ce conflit, une entité dévastatrice du nom
de Sin fit son apparition et réduisit Zanarkand à néant pour punir
les hommes de leur vanité. Effrayés par cette menace inattendue,
les habitants du reste de Spira se réunirent autour de la religion.
Ainsi naquit Yevon, le culte de la culpabilité. Depuis mille ans,
des Invokeurs se succèdent pour effectuer un pèlerinage ayant pour
but d'anéantir Sin... mais seulement pour une courte durée : la
Félicité. Jusqu'à présent, seules cinq Félicités ont eu été
apportées. La dernière en date est celle de Braska, il y a dix ans.
Mais déjà Sin est de retour. Et c'est sa fille, Yuna, qui se décide
à offrir au reste de Spira cet période de calme, espérant que cette
fois-ci sera la dernière : l'éternelle Félicité. Mais Sin
disparaîtra-t-il un jour ? Et surtout, d'où vient ce mystérieux
jeune homme nommé Tidus ?
